taller 6 Diagnostico no convencional de micosis

TALLER No. 6 

DIAGNÓSTICO DE INFECCIONES MICÓTICAS INVASIVAS POR TÉCNICAS NO  CONVENCIONALES  

1. Mencione las limitaciones que presentan las técnicas convencionales  usadas para el diagnóstico micológico. 

2. Detalle las ventajas que ofrecen las técnicas de diagnóstico molecular a la micología  clínica, desde el enfoque de identificación de los hongos. Enuncie las limitaciones  actuales de este tipo de herramientas diagnósticas. 

3. De las técnicas moleculares existentes, la más antigua y de mayor importancia es la  PCR. Defina esta técnica y detalle las ventajas, que en particular le puede proveer esta al diagnóstico de infecciones fúngicas. 

4. Realice un cuadro comparativo detallando los principales problemas relacionados con  el uso de la PCR para el diagnóstico de hongos. Describa en el cuadro las potenciales  soluciones a cada problema, además de las ventajas y desventajas.  

5. En la Aspergilosis Invasiva, ¿Cuál es el tipo de muestra recomendado para realizar  detección molecular de Aspergillus sp.? Argumente la respuesta. 

6. Mencione los tipos de PCR y los genes diana por los que se realiza convencionalmente  el diagnóstico molecular de Aspergilosis Invasiva. 

7. ¿Cuál es la recomendación que se debe tener en cuenta para evitar falsos-positivos de  Aspergilosis invasiva, al realizar la toma de muestra de sangre entera para detección  molecular? 

8. ¿Cuales son los principales aspectos a tener en cuenta según el EAPCRI para evitar  discrepancias entre los resultados de los distintos tipos de PCR para Aspergillus spp? 

9. Compare la técnica de PCR en cuanto a términos de sensibilidad y especificidad, frente  al diagnóstico molecular de Candidiasis invasiva frente al diagnóstico convencional por  hemocultivo.  

10. ¿Cuál o cuales son los tipos de muestra recomendados para el diagnóstico de  Candidiasis invasiva por PCR? 

11. Mencione los tipos de PCR y los genes diana por los que se realiza convencionalmente  el diagnóstico molecular de Candidiasis invasiva. 

12. Mencione los genes que pueden mutar y conferir resistencia a antimicóticos para las  diversas especies de Candida. 

13. Describa la precisión diagnóstica de la PCR en tiempo real para la detección de  Mucormicosis, en cuanto al tiempo de diagnóstico, con respecto a la histopatología o al  cultivo. 

14. Se han desarrollado y evaluado métodos de PCR para la detección de otras especies  de hongos, como Scedosporium spp., Cryptococcus spp., Coccidioides spp. y Fusarium  spp. ¿Por qué parece poco probable la posibilidad de implementación clínica de estos  ensayos de detección para estos hongos? 

15. En el ensayo de detección molecular de Cryptococcus spp, mencione los genes  conservados que se utilizan para el diagnóstico. 

16. ¿Cuales son las secuencias blanco usadas para la diferenciación entre Coccidioides  immitis y Coccidioides posadasii? 

17. Explique la utilidad de la técnica de espectrometría de masas MALDI-TOF en cuanto al  diagnóstico micológico. ¿Cuáles son las ventajas que ofrece esta técnica con respecto  a las técnicas convencionales para el diagnóstico micológico? 

18. En cuanto a la detección de componentes no antigénicos, describa la utilidad de la  prueba del D-arabinitol para la identificación de determinados agentes patógenos en  especifico. 

19. Enuncie el nombre de la técnica no convencional a través de la cual se detecta el D arabinitol, y en cual tipo de muestras. 

20. Explique el fundamento de la técnica para la detección de (1, 3) β-D-glucano.  Mencione diferentes marcas comerciales de esta técnica, y las micosis en las que  normalmente se recomienda su uso. 

21. Describa en que se basa el método de secuenciación de ácidos nucleicos fúngicos y  cual sería su utilidad en la micología clínica.

22. En la secuenciación de ácidos nucleicos fúngicos, ¿cuales son las regiones o segmentos  diana para la identificación de diferentes especies de levadura y hongos filamentosos?,  respectivamente.